国立台南大学因应新型冠状病毒（俗称武汉肺炎）疫情，于春节期间即成立“南大校园严重特殊传染性肺炎防疫小组”，掌握疫情并研议校园防疫及就学措施。黄宗显校长于2月4日上午召开第二次防疫小组会议，配合防疫政策及落实校园防疫措施，决议108学年度第二学期延至109年3月2日开学并取消开学典礼，中港澳生回台返校时采集中健康管理14天，无症状者始得上课，以期将群聚传染风险降至最低，维护师生及同仁健康安全。
南大防疫小组由黄宗显校长担任总指挥，依疫情变化随时召开防疫小组会议，进行疫情资讯搜集宣导及校内疫情防护。因应最新疫情变化，南大2月4日防疫小组会议决议以下事项：
一、108学年度第二学期延至3月2日开学。
二、取消108学年度第二学期开学典礼。
三、全面调查教职员生赴中港澳地区之接触史，符合居家检疫或自主健康管理之教职员生应主动告知所属单位(系所)，做好自主健康管理并回报所属单位(系所)。
四、陆生部分，已主动联系所有陆生24名，目前每位陆生健康状况均良好。陆生依政策得返校时，符合集中监测管理对象者将派专车接机，进行一人一室隔离健康观察14天。
五、港澳生返校时进行集中自主健康管理14天，无症状者始得上课。中港澳生返校安置单一窗口咨询为学务处杨素兰校安人员(06-2133111分机361)。
六、因防疫无法返校学生(含中港澳生及其他境外生)，就注册缴费、选课、修课、考试成绩、请假及休、退(复)学、毕业资格及相关辅导协助机制等面向，订定弹性修业机制，统一咨询窗口为教务处蔡雅芳秘书(06-2133111分机201)。
七、配合各项防疫政策，加强校园环境清洁及消毒，大型集会、考试进行人员量体温、戴口罩、酒精消毒之防疫措施。
八、成立防疫专属网页，随时公告最新防疫资讯。
南大黄宗显校长表示，面对严峻的疫情，南大采取严密的防疫措施及各项弹性的就学方案，请每位教职员生务必遵守落实，南大要以全面性的防疫，让所有师生及同仁安心上班与学习。