益菌生可透过健康食品或食物摄取，无论以何种形式补充，只要想增加肠内乳酸菌，减少坏菌的数量，就一定要摄取益菌生。
近来同时添加益生菌及益菌生的健康食品越来越多，因为透过食物摄取一日必要的益菌生并不容易，所以透过健康食品帮忙补充较方便。但是富含益菌生的食物，其中也含有许多对健康有益的成分，不仅对肠道有益，也能使身体更健康。富含益菌生的食物大多也富含膳食纤维，如菊糖除了是益菌生，也是膳食纤维的一种，其分解后也可制造出果寡糖。
食物1／菊苣根
在韩国，主要是食用菊苣的叶子或茎，当作包饭的生菜或沙拉食材。苦中带甜的菊苣可增添风味，也富含维生素与矿物质，是很健康的天然食材。不过益菌生成分较多的部位不是叶子和茎，而是根。
菊苣根有70％是菊糖，位于匈牙利布达佩斯的考文纽斯大学小儿科研究团队，在2018年的《营养学杂志》（The Journal of Nutrition）中，发表了菊苣根效果的相关研究论文。研究团队以209名三岁至六岁的儿童为对象，让他们连续六个月，每天从菊苣根中摄取6公克膳食纤维。结果发现受试者的粪便变软，粪便内的益菌数量也增加了，因为发烧而就医的比例则降低。此外，由于菊糖使血糖上升的速度较慢，也能帮助预防及控制糖尿病。
菊苣根最好的食用方式是用来泡茶，菊苣根晒干后炒过，再用热水浸泡后就可直接饮用。菊苣茶虽然有咖啡的味道，但咖啡因含量却比咖啡低很多。
食物2／菊芋
菊芋又称“洋姜”。因为有“芋”这个字，很多人都误以为是芋头的一种，但其实菊芋是一种菊科植物，跟芋头完全没有关系。其形状不像一般的芋头，外表凹凹凸凸很不起眼，但味道跟营养却完全不输芋头，尤其菊芋含有丰富的菊糖，非常适合当作益菌生的食物。
菊芋能用很多不同的方式料理，可像马铃薯一样剥皮生吃，也可用果汁机打成汁来喝，或是像马铃薯一样炖煮成小菜或加在汤里。不过菊芋晒干之后，菊糖的含量会更高，所以晒干后泡茶喝也是很好的选择。只要把菊芋切成薄片，晒干后加在水里煮来喝即可。
食物3／洋葱
洋葱也是富含菊糖的食物，不仅含有维生素与矿物质，也有丰富的膳食纤维，菊糖约占所有膳食纤维的一○％。菊糖不仅能够成为益菌的食物，协助益菌繁殖，更可帮助制造保护结肠的丁酸盐，及有效降低坏胆固醇的数值，刺激肠胃分泌消化液，提升消化功能。
