今日要闻
10月9日，国际学术期刊《细胞通讯》（Cell Reports）在线发表了中国科学院上海生命科学研究院（营养与健康研究院）计算生物学研究所韩敬东研究组的论文“Accurate Drug Reposition through Non-Tissue Specific Core Signatures from Cancer Transcriptomes”。该研究通过从多组织的癌症基因组学数据构建非组织特异性的基因突变的核心标签，并与药物基因组学数据整合，构建了药物-基因靶定模式和药物特异性的评估方法，为靶点预测及药物重定位研究提供了新视角。
针对药物重定位的大规模实验筛选常常被局限在基于体外细胞或非人模式动物的环境下进行，缺少对真实人体情况的反映。基于细胞实验的筛选结果通常带有细胞系特异性，而且所能研究的靶点数目有限。在该研究中，研究人员构建了基于人体内环境的无细胞或组织特异性偏好的高通量药物靶基因的计算筛选方法，从TCGA癌症数据库中提取了8476个人类编码基因的单基因突变的、非组织特异性的“转录组核心标签”并将癌症背景予以去除，从而构建了全基因组水平的单基因靶点的筛选体系；并开发了“核心标签-药物-基因相互作用”（core-signature Drug-to-Gene，csD2G）算法，用这8476个转录组核心标签分别扫描3546个药物处理转录组标签来预测药物重定位新靶点，并且构建药物-靶点特异性评估体系，为1938个药物和3758个基因筛选出179004个高特异性的药物-基因靶向关系。在靶点预测的覆盖率和特异性上，csD2G优于体外细胞实验基因干扰标签、L1000实验标签的药物-靶点预测以及现存的药物重定位算法。研究人员随后将该方法扩展到三方面研究予以应用：1）重定位一类抗精神病药物（吩噻嗪）去抑制TGF-β信号通路；2）重定位一类降血压药（钙离子通道拮抗剂）去激活AMPK、抑制AKT信号通路，并用临床电子病历验证；3）重定位并功能验证7个药物去特异选择性地靶向AKT-FOXO及AMPK通路，并延长线虫寿命。
药物重定位及应用的流程概念图
来源：上海营养与健康研究院
中国生物技术网诚邀生物领域科学家在我们的平台上，发表和介绍国内外原创的科研成果。
本公众号由中国科学院微生物研究所信息中心承办
微信公众号：中国生物技术网
您可能敢兴趣
声明: 凡注明为其他媒体来源的信息，均为转载自其他媒体，转载并不代表本网赞同其观点，也不代表本网对其真实性负责。如系原创文章，转载请注明出处; 您若对该稿件内容有任何疑问或质疑，请即联系，本网将迅速给您回应并做处理。邮箱：mail@laishu.com
为您推荐
校园贷再曝乱象这到底是什么情况,了解最新消息?
2018-04-15 21:34
8月分手魔咒：不平衡的爱情注定走不远
2018-08-21 11:37
饮食提醒切记红薯的“死对头”
2018-02-21 03:39
红唇族加烟酒 罹癌增123倍 医师告诉你危害不只这些...
2019-11-06 17:37
秋葵，生菜
2020-01-27 07:42:15
滑坡毁百年铁轨 怎么回事
2019-02-02 05:46
解读改善你的饮食的3款创新菜肴
2018-02-25 03:39
李湘为女儿庆生 一家人真是太有爱了
2019-01-25 19:26
生完二胎后首露脸!福原爱瘦14公斤身材纤细
2019-07-27 12:32
2018CBME孕婴童展益生碱奏响全球备孕最强音
2018-08-01 13:46
月经不调饮食来调
2018-04-01 10:37
粗盐热敷4个部位治好4大顽疾可惜很少有人会用
2019-03-05 22:46
讨厌金牛座的人 是因为不懂金牛座 他们其实和你想像中的不同
2019-07-02 16:13
他才出生四天，四肢黑到要截肢、一碰就可能死亡！这一切只因爸妈一个无知的决定…
2018-02-17 12:45
石家庄现天价板面 为何如此天价 哪些人来吃
2019-02-02 04:47
统一西武双狮联名活动 日职传奇球星东尾修开球
2019-07-15 21:31
街头最红三大台式水果茶!!斗分量斗特色斗选择
2018-05-13 22:37
9个月婴儿如何进行认知能力训练
2018-02-15 01:00
最会伤人、伤人至深的十二星座排行榜 人必有一死 死于天蝎或死于水瓶
2018-05-03 06:34
对现任够深情 对前任够狠心的星座 第一名：金牛座
2019-07-08 16:18
滴滴顺风车回归 具体何时能归 消费者：等你回归
2019-04-15 20:39
从“出汗多”看体质？谨记养生方法，值得收藏！-今日头条(www.toutiao.com)
2018-01-11 23:45
备孕 你知道备什么吗？
2018-09-05 09:51
宝宝颅内出血、脑死亡竟是因为掉床 孩子坠床后万不可做错这3件事…
2018-10-16 12:57
日职／令和的怪物石垣岛初上陆 专属商品卖翻天
2020-09-17 12:51:25
新光三越彩虹市集改装结集60家餐厅品牌这5家人气超旺
2018-05-11 12:39
蝉联七年癌症死因第一名！预防大肠癌吃两物：越浓稠越抗癌，日本人爱吃、不想得癌更要吃｜每日健康 Health
2019-03-21 21:53
每日排尿1500CC. 与尿路结石说再见
2019-10-25 18:35
原来这个八卦卦序的原理是这样的 其背后隐藏高深的宇宙奥秘
2018-05-10 04:36
只不过用硬币刮“这里”，不到3天！！五脏六腑的毒素竟然全排光了！便秘没了、气色也好了！效果太惊人。。。
2018-01-27 16:45
今日要闻
Dr. Martens联名X-GIRL释出霸气厚底系列！音乐人、潮流人都该来一双
真的来了！GD亲晒PEACEMINUSONE x Nike AF 1，白色“Para-Noise 2.0”超欠买！
adidas推出城市Online Run！王阳明、雷理莎脚踩Supernova、Boston 9限定鞋畅跑信义区
德国鞋履品牌Trippen秋冬新入荷！经典&创新任你选！
阿部千登势再推神作！sacai x Nike Vaporwaffle联名释出，四款新色攻陷你的荷包！
还有机会入手！Off-White x Air Jordan 5“色违”版本联名鞋即将开卖
Joel Embiid首代签名篮球鞋“UA Embiid One”台湾正式发售
Dr. Martens经典再进化！Heritage Distortion系列“双黄线”震撼登陆
