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近来生酮饮食掀起了一波潮流，这种饮食法的特色是糖类食物降到百分之十左右，脂肪占70%~80%，10%~20%是蛋白质食物，因此是一种极端往高脂肪食物靠拢的饮食型态，并非许多营养专家宣导的“均衡饮食”。身为一个肠胃科的医师，我不赞成一般人采取如此极端的饮食方式，原因如下：
问题1：不利产生乳酸菌
生酮饮食最大的问题，是饮食中严重缺乏糖类食物，这会影响肠道内的生化反应，例如厚壁菌门中最著名的益菌是乳酸菌，需要葡萄糖发酵而产生，进而产生短链脂肪酸，当肠道内欠缺葡萄糖时，肠道原有的酸碱度、生态都会随之改变。
问题2：增加腐败反应
高油脂、高蛋白的食物在肠道内走的是腐败反应，高油脂食物还会导致肠黏膜受伤、脂肪肝、肝脏纤维化等问题，干扰肠道菌与黏膜的恒定。
问题3：高脂食物并非人类天然主食
人类的牙齿构造也显示生酮饮食并不符合演化的原则，牙齿中负责研磨的臼齿占多数，高达二十颗，撕裂肉品的犬齿共四颗，加上切断食物的门齿八颗，足见谷类食物才是人类的自然主食。
问题4：是生酮饮食改善了过敏？
有些人表示，他们吃了生酮饮食之后成功改善了过敏，这可能是他们原来吃错了糖类食物。许多人的糖类来源为小麦制品（面条、面包、蛋糕、饼干等），当中含有容易导致过敏的麸质，采用生酮饮食的人不会再吃小麦制品，过敏症状自然消失。
但是糖类食物不只有小麦，米饭、根茎类食物（地瓜、马铃薯、山药、莲藕等）都含有糖分，而且很少人会对这些食物过敏。因此有过敏的人应该优先采取“无麸质饮食”，而不是生酮饮食。
问题5：并非健康的减肥方式
也有不少人吃生酮饮食是为了减肥，食物中减少淀粉比例的确也减掉了热量来源，有可能会变瘦，但高脂肪的食物会导致体内囤积更多脂肪，形成脂肪肝，增加胰岛素抗性，长期来看，不但无助于减肥，也可能愈减愈不健康。
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